Ny artikkel argumenterer for at ulike genetiske koder best forklares med felles design
Av Jonathan McLatchie, 25. juni 2024. Oversatt herfra

Et populært argument for en universell felles stamfar er det nesten universelle, ved den konvensjonelle genetiske koden. Kritikere av felles avstamning peker ofte på avvik fra standardkoden som bevis mot den. En fersk artikkel publisert i tidsskriftet BIO-Complexity, av Winston Ewert, gjennomgår karakteren og distribusjonen av genetiske kodevarianter og implikasjonene disse har for felles aner, og "utvikler et rammeverk for å forstå koder innenfor et felles designramme, basert avgjørende på forutsetningen om at noen genetiske kodevarianter er designet og andre er et resultat av mutasjoner til oversettelsesmaskiner. Ewert forklarer det,

Bilde 1. DNA

"Ved første undersøkelse ser det ut til at evolusjonsteorien har en overbevisende beretning om karakteren og distribusjonen av variantkoder. Evolusjonsteorien antyder at hvis genetisk kodeutvikling er mulig, bør det være veldig sjelden. Dette vil forklare hvorfor de fleste genom følger standardkoden og hvorfor unntakene bare varierer i noen få kodoner. Det vil også forklare følgende detaljer om variantkodene. De fleste variasjoner finnes i mitokondrier, hvis veldig små genom vil gjøre kodeutviklingen enklere. Mange variasjoner finnes også i sterkt reduserte genom, slik som for endosymbiotiske bakterier. Ingen variasjoner finnes i kjerne- genomene til komplekse flercellede organismer som planter og dyr. Fordelingen av mange koder kan enkelt forklares ved å identifisere visse punkter på livets tre, der kodoner ble tildelt og deretter arvet av alle deres etterkommere."
--EWERT W (2024) ON THE ORIGIN OF THE CODES: THE CHARACTER AND DISTRIBUTION OF VARIANT GENETIC CODES IS BETTER EXPLAINED BY COMMON DESIGN THAN EVOLUTIONARY THEORY. BIO-COMPLEXITY 2024 (1):1-25.

Tre ramme-grunnlag
Oppgaven foreslår "et rammeverk som søker å forklare karakteren og distribusjonen av variante genetiske koder innenfor et felles designramme." Ewerts rammeverk har tre grunnlag: Først "Den kanoniske genetiske koden har vært godt optimalisert og er dermed et ideelt valg for de fleste genom." Det er flere optimaliserte parametre, og dermed "en designer må identifisere de beste avveiningene, for å velge den ideelle genetiske koden." Det andre grunnlaget for Ewerts ramme er at en mindre variasjon for standardkoden er bedre egnet for en eller annen organisme, siden denne organismen kan tilegne seg en fordel, ved et annet sett av avveininger med hensyn til genetisk kodeoptimalisering. Det tredje grunnlaget er at oversettelsesmaskineriet har blitt skadet av mutasjoner i noen organismer, og det har resultert i at deres feiltolking av koden de opprinnelig ble designet for å bruke. Dette er eksempler på genetiske kodevarianter som har utviklet seg naturlig.

Bilde 2. Grunnlag for skeptisk holdning (Behes 3 varsellamper)

Fem kriterier
Ewert tilbyr fem kriterier som kan brukes til å skille genetiske koder som er utviklet fra de som er designet. For det første forventes det at utviklede koder blir funnet i taksonomiske grupper under familenivået, mens de som er designet er spådd å være over familie-nivå. For det andre bør utviklede koder lett være "forklarbare med tanke på en enkel mutasjon til cellenes oversettelsesmaskineri." For det tredje er det spådd at koder som er utviklet vil være begrenset til genomet til endosymbionter. For det fjerde forventes det at koder som er utviklet utnytter et lite antall kodoner, slik at variasjonen ikke forårsaker at organismen får for mye skade. For det femte er det spådd at utviklede koder vil falle i en enkel nestet hierarkisk (fylogenetisk) fordeling. Derimot,
"Designede kodoner finnes i taxi på høyt nivå på minst slektnivå, men typisk høyere. De involverer mange omfordelinger som er vanskelige å forklare med noen slag enkel mutasjon. De finnes i frittlevende organismer. De omfordeler noen ganger kodoner som forventes å være sjeldne. De blir ofte distribuert på en kompleks måte som ikke passer fylogenetiske forventninger."
EWERT W (2024) ON THE ORIGIN OF THE CODES: THE CHARACTER AND DISTRIBUTION OF VARIANT GENETIC CODES IS BETTER EXPLAINED BY COMMON DESIGN THAN EVOLUTIONARY THEORY. BIO-COMPLEXITY 2024 (1):1-25.

Det har blitt antatt konvensjonelt at evolusjon gir en god forklaring på karakteren og distribusjonen av genetiske kodevarianter-i spesiell, nesten-universaliteten til standardkoden; Utbredelsen av variantkoder i enkle genomer som mitokondrier; og den fylogenetiske fordelingen av variantkoder. Ewert bemerker at det i lys av evolusjonsteorien faktisk vil forventes at det ville være variantkoder som er funnet på de høyere taksonomiske nivåene, noe som vil være i samsvar med at den genetiske koden fremdeles ville være variabel på tidspunktet for den siste felles stamfar. Imidlertid "det vi observerer i stedet er endringer av standardkoden. De er ikke assosiert med taxa på høyt nivå .. "
Videre, selv om vi ut fra evolusjonsteorien kan forvente at det ville være eksponentielt vanskeligere å tilordne en kode etter hvert som antallet gener øker, "varianter av koder i kjerne-genomer som ikke er spesielt små. De finnes i ciliater, som har sammenlignbare antall gener med det menneskelige genomet. I tillegg finner vi dem i noen flercellede grønne alger. Faktisk finner vi mer kodevariasjon i eukaryote kjerne-genom enn i bakteriegenom, til tross for at eukaryoter har det mye større genomet. " Dermed konkluderer Ewert, "Til tross for det første inntrykket, står evolusjonsteori ikke godt for de typer genomer med variante koder."

Bilde 3. Det går et skille mellom familier og ordener (Ewert)

Påkalle "uforklarlige hendelser"
Til slutt, selv om evolusjonsteori ville forutsi at fordelingen av variante koder ville være i samsvar med standard fylogeni, observerer Ewert at, "i mange tilfeller er fordelingen av en kode kompleks og trosser evolusjonære forklaringer. Koder gjentar seg i nært beslektede grupper på en måte som ikke er forklart av felles avstamning. Evolusjonsteori må påkalle uforklarlige hendelser som reverseringer til standardkoden.
Dermed konkluderer Ewert, "Opprinnelig syntes evolusjonsteori å ha en viss forklarende kraft. Ved nærmere inspeksjon viste imidlertid funksjonene i variantkodene som virket godt forklart av evolusjonsteori å være unøyaktige eller ikke følge av evolusjonsteorien. " I stedet argumenterer han for at karakteren og distribusjonen av variantkoder ofte blir bedre forklart under et rammeverk for vanlig design.

Oppgaven er vel verdt en nøye lesning. Det kan nås her.

JONATHAN MCLATCHIE
RESIDENT BIOLOG & stipendiat, SENTER FOR VITENSKAP OG KULTUR
Dr. Jonathan McLatchie har en bachelorgrad i rettsmedisinsk biologi fra University of Strathclyde, en mastergrad (M.Res) i evolusjonsbiologi fra University of Glasgow, en annen mastergrad i medisinsk og molekylær biovitenskap fra Newcastle University, og en doktorgrad i evolusjonær Biologi fra Newcastle University. Tidligere var Jonathan assisterende professor i biologi ved Sattler College i Boston, Massachusetts. Jonathan har blitt intervjuet på podcaster og radioprogrammer, inkludert "Unbelievable?" på Premier Christian Radio og mange andre. Jonathan har talt internasjonalt i Europa, Nord-Amerika, Sør-Afrika og Asia for å fremme bevis på design i naturen.

Oversettelse, via google oversetter, og bilder ved Asbjørn E. Lund